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seqtrimnext 2.0.59

SeqtrimNEXT is a customizable and distributed pre-processing software for NGS (Next Generation Sequencing) biological data. It makes use of scbi_mapreduce gem to be able to run in parallel and distributed environments. It is specially suited for Roche 454 (normal and paired-end) & Ilumina datasets, although it could be easyly adapted to any other situation.

Gemfile:
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インストール:
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バージョン履歴:

  1. 2.0.68 December 14, 2016 (87.5KB)
  2. 2.0.66 May 25, 2016 (87.5KB)
  3. 2.0.62 January 20, 2016 (86KB)
  4. 2.0.61 January 19, 2016 (85.5KB)
  5. 2.0.60 July 23, 2015 (85KB)
  6. 2.0.59 March 03, 2014 (80KB)
全てのバージョンを表示(全29件)

Runtime依存関係 (11):

gnuplot >= 0
narray >= 0
scbi_blast >= 0.0.34
scbi_fasta >= 0.1.7
scbi_fastq >= 0.0.18
scbi_headers >= 0.0.2
scbi_mapreduce >= 0.0.38
scbi_math >= 0.0.1
scbi_plot >= 0.0.6
term-ansicolor >= 1.0.5
xml-simple >= 1.0.12

Development依存関係 (3):

hoe ~> 3.7
newgem >= 1.5.3
rdoc ~> 4.0

所有者:

作者:

  • Dario Guerrero & Almudena Bocinos

SHA 256チェックサム:

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累計ダウンロード数 79,713

このバージョンのみ 2,539

このバージョンがリリースされたのは:

ライセンス:

MIT

必要なRubyのバージョン: なし

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